肩部疼痛是常見的肌肉骨骼主訴，可能源於肩部內在疾病（Intrinsic disorders）或牽涉痛（Referred pain）。
內在疾病包含肩關節、肌腱、周圍韌帶或關節周圍結構的損傷，以及急性或慢性退化與發炎。
人類肩部擁有比全身任何關節都更大的活動度。肩帶（Shoulder girdle）由三塊骨頭（鎖骨、肩胛骨、近端肱骨）與四個關節面（胸鎖關節 SC、肩峰鎖骨關節 AC、盂肱關節 Glenohumeral、肩胛胸廓關節 Scapulothoracic）組成，其中盂肱關節是最主要的關節。
穩定度機制：肱骨頭表面僅有 25% 與肩盂（Glenoid）接觸。附著於肩盂外緣的纖維軟骨環——肩盂唇（Labrum）提供了額外的深度與穩定度。
主要靜態穩定構造：上、中、下盂肱韌帶（Glenohumeral ligaments）。
主要動態穩定構造：旋轉肌袖（Rotator cuff），負責在維持完整活動度的同時將肱骨頭固定在肩盂內。
旋轉肌袖四條肌肉（SITS）：
棘上肌（Supraspinatus）：起自肩胛岡上方的棘上窩，止於肱骨頭外上方的大結節（Greater tuberosity）（緊鄰二頭肌腱後方），與三角肌共同負責外展（Abduction）。在止點近端會與肩峰下滑囊（Subacromial bursa，又稱三角肌下滑囊）一起穿過肩峰（Acromion）與肱骨頭之間的狹窄空間，因此肩部外展時極易受到夾擠（Impingement），是肩痛最常見的受傷部位。
棘下肌（Infraspinatus）：起自後肩胛骨棘下窩，止於大結節（棘上肌後方），為主要的外旋肌（External rotator）。
小圓肌（Teres minor）：起自後下肩胛骨，與棘下肌融合止於大結節，負責外旋。
肩胛下肌（Subscapularis）：四條肌袖中最大者，起自前肩胛骨（喙突下方），止於肱骨頭前方的小結節（Lesser tuberosity），負責內旋（Internal rotation），其產生的力量約為外旋肌群的兩倍。
生物力學平衡：三角肌（Deltoid）為最表淺的主要外展肌。旋轉肌袖將肱骨頭壓入肩盂窩以抗衡三角肌向上的拉力；若旋轉肌袖無力，當手臂外展超過 90 度時會導致肱骨頭向上半脫位，進而誘發夾擠症候群。
肩胛上神經（Suprascapular nerve）：支配棘上肌與棘下肌。受壓迫（常由囊腫或腫瘤引起）佔肩部病變的 1%–2%，會引起疼痛、進行性肌肉萎縮及外展與外旋無力，臨床上難以與旋轉肌袖撕裂區分。
肩胛胸廓協調性：斜方肌（Trapezius）、前鋸肌（Serratus anterior）、菱形肌（Rhomboids）與提肩胛肌（Levator scapulae）負責穩定並移動肩胛骨，使喙肩峰弓（Coracoacromial arch）適當抬高，減少夾擠風險。
肱二頭肌長頭肌腱（Long head of the biceps tendon）：行經近端肱骨前方的結節間溝（Bicipital groove），由橫肱韌帶或肩胛下肌腱延伸結構固定，其損傷或退化會引起前肩痛。
其他輔助動態穩定肌：大圓肌、闊背肌、胸大肌。
臂神經叢（Brachial plexus）：行經盂肱關節下方，其急性或慢性損傷亦可表現為肩痛。
急性肩痛（通常小於 2 週）常源於外傷；若無外傷史，臨床醫師必須先區分外在（Extrinsic，即牽涉痛）與內在（Intrinsic）病因，並詢問工作/休閒中的過肩動作、既往傷病史及糖尿病（會顯著增加沾黏性肩關節囊炎風險）。
前外側肩痛（Anterolateral shoulder pain）：
舉手過肩時加劇是最常見的型態，常與夾擠症候群及各階段的旋轉肌袖病變（拉傷、肌腱病變、鈣化性肌腱炎、肌腱撕裂）有關。
若合併顯著的外旋或外展無力，高度懷疑旋轉肌袖撕裂。
若合併僵硬及主動與被動活動度（特別是外旋與外展）顯著喪失，最可能為沾黏性肩關節囊炎（冷凍肩 / 五十肩）。
肩盂唇撕裂（如 SLAP lesion）可表現為深層、難定位的前外側痛，伴隨不穩定感與卡住感（Catching）。
二頭肌長頭肌腱病變則表現為定位明確的前肩痛，提重物（如購物袋）時加劇。
上方肩痛（Superior shoulder pain）：
患者常能用「一根手指」直接指出鎖骨遠端，提示肩峰鎖骨關節（AC joint）病變（外傷性 AC 分離、骨關節炎、遠端鎖骨骨溶解）。手臂橫跨胸前（內收）、夾擠動作或側睡壓迫時會誘發疼痛。
後方肩痛（Posterior shoulder pain）：
最少見的內在型態。外旋肌群（棘下肌、小圓肌）肌腱病變會引起肩胛骨局部痛與外旋無力；而上斜方肌區域較瀰漫的疼痛，通常是由頸椎（頸部拉傷或神經根病變）牽涉而來。
定位不明確的疼痛（Poorly localized pain）：
內在原因（常伴隨僵硬、活動受限與夜間痛）：盂肱關節炎、肱骨頭缺血性壞死（AVN）、骨腫瘤/囊腫、大型旋轉肌袖撕裂、沾黏性肩關節囊炎。
神經壓迫：肩胛上神經病變（外展與外旋無力）、四邊孔症候群（Quadrilateral space syndrome，腋神經受壓迫導致肩外側感覺喪失與疼痛）。
外在牽涉痛：若肩部理學檢查完全正常，需高度懷疑頸椎神經根壓迫（尖銳放射痛）、腹腔內病變（膽囊疾病、肝脾出血引起橫膈膜刺激之 Kehr 徵象）或急性冠心症（ACS）。此外，無臨床發現的非特異性肩痛亦可能與憂鬱症有關。
輕微鈍傷最常引起鎖骨骨折、近端肱骨骨折、盂肱關節脫位、AC 關節扭傷。應安排一般 X 光檢查；若外傷後 X 光正常，則可能為軟組織損傷（如旋轉肌袖撕裂）。
外在病因特徵：疼痛模糊難定位（胸腹來源）或呈電擊放射狀（神經來源）、伴隨其他症狀（呼吸困難、腹痛、盜汗）、肩關節活動不會誘發疼痛，且雙肩外觀、活動度與肌力完全對稱。
盂肱關節外病變：患者能精確定位痛點（如二頭肌溝、AC 關節），且盂肱關節的被動活動度（Passive ROM）正常。唯獨「肩胛穩定肌群無力」較難診斷，需仔細觀察肩胛胸廓運動與是否有翼狀肩胛（Scapular winging）。
透過評估關節活動度（ROM）、肌力與夾擠徵象進行區分：
夾擠症候群與旋轉肌袖肌腱病變：過肩動作引發前外側痛、棘上肌測試或外旋疼痛、夾擠測試（Neer / Hawkins test）陽性、被動 ROM 與肌力正常。
旋轉肌袖肌腱撕裂：多見於 > 40 歲患者，表現同肌腱病變，但伴隨阻力下外展與外旋顯著無力。
沾黏性肩關節囊炎（冷凍肩）：有糖尿病或固定不動病史（如中風、使用三角巾），主動與被動 ROM 皆顯著下降。
盂肱關節骨關節炎：既往肩部外傷史、疼痛、主動與被動 ROM 皆下降，X 光可見硬化與關節腔狹窄。
多方向肩關節不穩定（Multidirectional instability）：多見於 < 40 歲（特別是游泳與投擲運動員或年輕女性），溝徵象（Sulcus sign）與不穩定測試（Apprehension / Relocation test）陽性。
上方肩盂唇前後向撕裂（SLAP tear）：投擲或過肩運動員/勞動者，肩部外展且外旋時症狀最明顯。
旋轉肌袖損傷與夾擠：棘上肌腱最易受損（特別是 > 30 歲、圓肩姿勢、鉤狀肩峰 Type III hooked acromion 者）。患者描述疼痛時常將手放在三角肌外側上下撫摸；撕裂傷患者常有嚴重夜間痛。
沾黏性肩關節囊炎（Frozen shoulder）：幾乎皆為關節囊的可逆性攣縮，最常繼發於旋轉肌袖肌腱病變或糖尿病。患者無法摸背（內旋受限）、穿外套困難或無法舉手（外展與外旋受限）。
肩峰鎖骨（AC）關節痛：Apley 摸背測試（Apley scratch test）的內收動作（手橫跨胸前摸對側肩膀）可誘發疼痛；二、三度 AC 扭傷可見明顯的階梯狀變形（Step-off deformity）。
二頭肌腱病變與斷裂：長頭肌腱急性斷裂會出現上臂遠端突起之「卜派變形（Popeye deformity）」。因肱撓肌與二頭肌短頭提供了 80%–85% 的屈肘力量，故長頭肌腱斷裂極少造成顯著屈肘無力。
盂肱關節骨關節炎：原發性極少見，多繼發於既往脫位、骨折或大型肌袖撕裂；若無外傷史，應考慮代謝性疾病（如血色沉著病 Hemochromatosis）。
肩胛骨不穩定（Scapular instability）：表現為肩胛運動障礙（Scapular dyskinesis，如 SICK scapula 症候群）或輕微翼狀肩胛。若檢查者用手幫忙固定肩胛骨能使患者外展肌力改善（肩胛協助測試 Scapular assistance test），即提示肩胛穩定肌無力。長胸神經（Long thoracic nerve）受損則會導致明顯的翼狀肩胛。
肩峰下/三角肌下滑囊炎與肩胛胸廓滑囊炎：後者好發於肌肉不發達、駝背或反覆前後移動肩胛骨（如燙衣服、投擲）者，聳肩時上背部肩胛骨內上角（與第 2、3 肋骨摩擦處）會有局部痛或彈響。
敗血性關節炎（Septic arthritis）與敗血性滑囊炎（Septic bursitis）：表現為發燒、急性紅腫熱痛。敗血性關節炎多為血行性感染（MRSA 常見），需抽關節液培養，延誤治療可致截肢或死亡；敗血性滑囊炎則多由皮膚穿刺或鄰近軟組織感染直接蔓延所致。
風濕性多肌痛症（Polymyalgia rheumatica, PMR）：僅見於 > 50 歲成人，表現為雙側肩膀、髖帶與頸部的關節痛與晨間僵硬。
惡性腫瘤骨轉移：骨頭是僅次於肺與肝的第三大轉移部位，最常轉移至肩部骨頭的癌症為乳癌、攝護腺癌、肺癌、甲狀腺癌與腎臟癌，常伴隨夜間盜汗與體重減輕。
少見但嚴重的病因：感染性心內膜炎（合併轉移性敗血性關節炎）、深頸部膿瘍（Deep neck abscess）、肺尖腫瘤（Pancoast tumor，侵犯臂神經叢引起肩痛，常合併同側眼瞼下垂、瞳孔縮小、無汗症之 Horner 症候群）。
罕見病因：萊姆病（Lyme disease，伴隨遊走性紅斑）、成人史迪爾氏症（Still's disease）、結晶性關節炎（CPPD 比痛風常侵犯肩膀；鹼性磷酸鈣 Basic calcium phosphate 結晶沉積好發於年長女性雙肩，會造成快速破壞性的「密爾瓦基肩症候群 Milwaukee shoulder syndrome」）、出血性滑囊炎（Hemobursa，見於外傷或使用抗凝血劑者）、肱骨頭缺血性壞死（AVN）、纖維肌痛症（Fibromyalgia）。
於肩峰中點下方 1 至 1.5 吋（2.5–4 cm）處平行肩峰進針，將 1 mL Lidocaine 注入三角肌、1–2 mL 注入肩峰下滑囊：
旋轉肌袖肌腱病變：疼痛緩解後，肌力與活動度恢復正常。
旋轉肌袖撕裂：即使疼痛緩解，依然持續無力。
冷凍肩（沾黏性關節囊炎）：即使注射止痛，關節活動度依然受限。
一般 X 光（Plain radiographs）：非外傷性肩痛效益有限，建議用於有外傷史、活動度喪失（特別伴隨劇痛）的患者。
旋轉肌袖撕裂的間接 X 光證據：肱骨頭向上移位（High-riding humeral head），且肩峰下空間小於 1 cm。
鈣化性肌腱炎：休止期（Resting phase）呈邊界清晰的緻密鈣化；吸收期（Resorptive phase）呈邊界模糊的蓬鬆狀（Fluffy）外觀。
磁振造影（MRI）與關節造影（MRA）：MRI 為評估旋轉肌袖軟組織、AVN 與腫瘤的首選；但須注意 40 歲以上無症狀成人高達 96% 在 MRI 上有旋轉肌袖異常（包含 25% 肌腱病變、62% 部分撕裂、11% 全層撕裂），必須配合臨床表現判讀。MR 關節造影（MR arthrography）則是評估肩關節不穩定與肩盂唇撕裂（Labral tear）的首選。
肌肉骨骼超音波（Ultrasonography）：在技術純熟的操作者手中，診斷旋轉肌袖撕裂、二頭肌腱撕裂與脫位的準確度與 MRI 相當，且費用更低、病患接受度更高，並可同時引導介入性注射治療。
